1959-1984年历任南京大学物理系助教、讲师、副教授、教授，1982-1984年应聘为美国犹他大学物理系访问副教授，1986-1987年应聘为日本东北客座教授，1986-1992年任国家自然科学基金委物理学科组组长，1992年任国家教委科技委物理学科组组长，1987-1994年任南京固体微结构物理国家重点实验室常务副主任，1989-1993年任南京大学材料科学与工程系主任，1989年任南京大学材料科学研究所所长、国家科委人工晶体联合研究与发展中心主任，1990-1991年应聘为美国Alabama大学微重力与材料研究中心访问教授， 1994年任南京大学固体微结构物理国家重点实验室主任、国家教委科技委副主任，1995年任国家教委微结构科学技术高等研究中心主任、南京大学固体物理研究所所长，1997年任江苏省自然科学基金委主任。

曾获 1964年"工业新产品"二等奖、1982年国家自然科学二等奖、1983年美国犹他大学及习弹公司颁发的"大力神"奖、1986年国家教委科技进步二等奖、1994年国家教委科技进步二等奖。1995年被评为全国优秀教师，1997年获国家级教学成果一等奖。编著的《晶体生长的物理基础》一书获国家优秀科技图书一等奖。

　　在2006年度国家科学技术奖励大会上，闵乃本院士领衔完成的《介电体超晶格材料的设计、制备、性能和应用》获国家自然科学奖一等奖。这也是自1999年国家奖励制度改革以来内地高校独立完成的首个国家自然科学一等奖。

　　1986年，闵乃本提出“介电体超晶格”材料的概念，并设想将准晶结构引入介电体超晶格中。经过近3年探索，闵乃本和学生朱永元教授等建立了“准周期超晶格”的理论，并预言“一块准周期的介电体超晶格有可能将一种颜色激光同时转换成三四种颜色的激光”。1992年起，课题组人员集体攻关，用两年多时间成功推出“室温图案极化制备介电体超晶格”新技术。1995年，课题组用这种新技术制备出周期超晶格。1996年制备出同时能出二种颜色激光的准周期介电体超晶格。2005年，课题组利用自行研制的介电体超晶格，研制成功全固态超晶格红、绿、蓝三基色和白光激光器，制出样机，取得了4项国内发明专利和1项美国发明专利。

　　目前，介电体超晶格的应用受到国际同行关注。据介绍，“介电体超晶格”材料如用于制造医用激光器，既可查病灶，又可用于治病，医用前景广阔。